畜牧獸醫系與新希望六和股份有限公司、四川德康農牧食品集團股份有限公司、內蒙古正大食品有限公司、河北康宏牧業有限公司、黑龍江林甸優然牧業有限責任公司、黑龍江康貝牧業有限公司、杜爾伯特蒙古族自治縣中都畜牧有限責任公司等國內規?；翀?；北京明安星動物醫院、呼和浩特寵康動物醫院、內蒙古宋大夫動物醫院等20多家知名動物醫院建立了長期穩定的校企合作關系。

2016年至今，以內蒙古正大集團、北京明安星動物醫院為代表的企業為我系先后捐助價值4000元專業書籍；捐助小動物標本 15件；為我系參加校運會捐助1萬元人民幣。采取“場中校，校中場”模式的合作育人方式，通過企業教師進校園、實習學生進入企業跟崗實習和頂崗實習學生合作教學。同時利用寒暑假選派專業教師尤其年輕教師到企業參加實踐。自2015年以來，利用寒暑期參加企業實踐老師共40多人次。通過實踐，專業教師們才能真正將理論與實踐結合，將實踐成果有效轉化。